Tutti i viaggi alle isole Galapagos iniziano e terminano a Santa Cruz. Qui si trova il Charles Darwin Research Center, che propone approfondimenti sui programmi di conservazione della fauna locale. Poco distante sorge il Fausto Llerena Tortoise Center, dove si possono osservare diverse specie di tartarughe giganti. La città principale è Puerto Ayora. Dal centro è possibile effettuare un interessante trekking di circa un’ora fino a Tortuga Bay, che comprende due spiagge: una più esposta alle correnti e una più riparata, perfetta per nuotare. La Laguna di Garrapatero, una ventina di chilometri dalla città, è invece il luogo di avvistamento dei fenicotteri rosa.