Il centro di Isabela è Puerto Villamil, un tranquillo villaggio di pescatori, oggi divenuto punto di arrivo per i turisti in visita. Una delle principali attività è il trekking al vulcano Sierra Negra. Con una caldera di dieci chilometri di diametro, è il più maestoso delle isole Galapagos. Per arrivare sono necessarie diverse ore di camminata a piedi o a cavallo. Per chi non se la sente di arrivare fino in cima, è possibile fermarsi al Vulcano Chico, di dimensioni minori ma con viste mozzafiato sui vulcani di Isabela e della vicina Fernandina. Tra le specie più presenti sull’isola ci sono i fenicotteri, che si possono avvistare nel Pozo de Los Flamingos, poco distante da Puerto Villamil.